微噴灌與滴灌、噴灌有一些近似之處，但也存在著明顯的區別，它具有獨自的特點。

(1)微噴灌中微噴頭在布置上有很大的任意性，除非果樹間距非常小，主要以單噴頭噴灑為主，屬于局部灌溉。在實用中很少用到噴灌中常用的組合均勻度的概念。

(2)對微噴頭工作特性的要求高。微噴頭一般不依靠附近噴頭補償其降水，而且只能在很低的位置以低仰角覆蓋一定的范圍。同時，對各種不同的噴灑直徑要求、不同的降雨強度和土壤都需在不犧牲均勻度的條件下去逐一滿足。

(3)通過對微噴頭的合理選擇和使用可以進一步提高灌溉水的利用率。一般噴灌的節水在于合理控制灌水深度，減少灌溉水在田間的深層滲漏，強調灌水范圍內的灑水均勻性。